Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RrhO35214 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RrhO35214 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RrhO35214 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RrhO35214 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RrhO35214 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RrhO35214 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RrhO35214 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms