Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms