Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Polr1aO35134 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms