Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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