Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn4O35054 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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