Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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