Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NumblO08919 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NumblO08919 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NumblO08919 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NumblO08919 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NumblO08919 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NumblO08919 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NumblO08919 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NumblO08919 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NumblO08919 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NumblO08919 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms