Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MttpO08601 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MttpO08601 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MttpO08601 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MttpO08601 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MttpO08601 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms