Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm3239L7N2D9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm3239L7N2D9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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