Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20878L7N244 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20878L7N244 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20878L7N244 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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