Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20939L7N243 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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