Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8888J3QPX5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms