Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms