Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5849J3QPE5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5849J3QPE5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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