Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm19965J3QNY8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms