Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3336J3QMQ6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3336J3QMQ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms