Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp994J3QM38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp994J3QM38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms