Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms