Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Cldn34c3J3QJW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c3J3QJW5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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