Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm21411J3KMS0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm21411J3KMS0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm21411J3KMS0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm21411J3KMS0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm21411J3KMS0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm21411J3KMS0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21411J3KMS0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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