Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp408H7BX78 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms