Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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