Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms