Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc9a3G3X939 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms