Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim15G3UY57 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms