Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer4cG3UXD1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms