Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp72F8VQC1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms