Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6F8VPZ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms