Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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