Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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