Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms