Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms