Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms