Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17093F6XGJ4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms