Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms