Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms