Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf4E9QAP7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms