Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cald1E9QA15 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms