Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc7bE9Q9Y3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc7bE9Q9Y3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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