Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Simc1E9Q6E9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms