Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srsf11E9Q6E5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srsf11E9Q6E5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srsf11E9Q6E5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srsf11E9Q6E5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srsf11E9Q6E5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srsf11E9Q6E5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf11E9Q6E5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms