Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BC005561E9Q5E2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BC005561E9Q5E2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms