Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms