Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms