Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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