Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzd2E9Q1M1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms