Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo5cE9Q1F5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Myo5cE9Q1F5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo5cE9Q1F5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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