Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt78E9Q0F0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms