Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms