Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ryr1E9PZQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms